CodonCode Aligner

ការពិពណ៌នា

CodonCode Aligner គឺជាកម្មវិធីដែលងាយស្រួលប្រើសម្រាប់ការដំឡើង DNA លំដាប់ ការតម្រឹម ការកែសម្រួល contig និងការរកឃើញការផ្លាស់ប្តូរ។ Aligner គឺត្រូវគ្នាជាមួយ Phred-Phrap និងគាំទ្រយ៉ាងពេញលេញនូវពិន្ទុគុណភាពលំដាប់ ខណៈពេលដែលផ្តល់ជូននូវចំណុចប្រទាក់អ្នកប្រើដែលធ្លាប់ស្គាល់ និងងាយស្រួលរៀន។ លក្ខណៈពិសេសរួមមានការនាំចូលតាមលំដាប់ពីឯកសារអត្ថបទ តម្រឹម contigs ទៅគ្នាទៅវិញទៅមក ខណៈពេលដែលរក្សាតំណភ្ជាប់ទៅដាន ស្វែងរកការផ្លាស់ប្តូរតំណពូជ កំណត់តំបន់ចាប់អារម្មណ៍ ("លក្ខណៈពិសេស") នាំចូល និងកែសម្រួលការជួបប្រជុំគ្នាដែលបង្កើត Phrap លំដាប់នាំចេញ និងលក្ខណៈពិសេស នាំចូលលំដាប់។ ពីឯកសារ ABI និង SCF ការកាត់វ៉ិចទ័រ តម្រឹមទៅលំដាប់យោង វិភាគការបញ្ចូល និងការលុបតំណពូជ រុករករវាងលក្ខណៈពិសេសដែលកំណត់ដោយអ្នកប្រើប្រាស់ និងនាំចេញគម្រោងការជួបប្រជុំគ្នាដែលត្រូវគ្នា។